Pour accomplir ses missions et atteindre les objectifs qu’il s’est assigné, le Secrétariat Exécutif de la CPC a mis en place une structure organisationnelle avec un pool d’experts de profils diversifiés constitué de spécialistes de l’économie coopérative, de la microfinance, du développement organisationnel, de l’entrepreneuriat de groupe et de l’entrepreneuriat individuel, du management des entreprises. Il dispose en outre d’un réseau de connaissances animé par les membres du Conseil d’Administration présents dans plus d’une dizaine de pays et capables de l’aider à identifier d’autres expertises si le besoin se fait sentir. Ses organes principaux sont :

1.L’Assemblée Générale (A G) ;
2.Le Conseil Consultatif (Ministres et Partenaires) ;
3.Conseil d’Administration (CA);
4.Le Secrétariat Exécutif (S E).

Outre le Secrétariat Exécutif le CA a sous son autorité l’Université Africaine de Développement Coopératif (UADC Cotonou- Bénin), le Centre d’Appui Conseil (CAC) logé au Secrétariat Exécutif à Yaoundé au Cameroun et la Banque Africaine de Développement Coopératif (BADCOOP) en gestation.